アメリカ軍はかつてソ連から亡命してきた電子戦の技術開発に優れるDr.V・ワルターを本土返還間近の沖縄に派遣し、レーダーシステムの整備を急いでいた。一方、ソ連KGBはワルターを殺害するためにゴルゴを沖縄へ送り込んでくる。ゴルゴは琉球大学で講演に訪れたワルターを難なく狙撃してミッションを遂行する。しかし任務を終えたゴルゴを待っていたものは、KGBの裏切りだった。KGBから情報をリークされたアメリカCIAもゴルゴを捕獲しようと迫ってくる。